SNP(Single Nucleotide Polymorphisms),單核苷酸多態(tài)性,是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類(lèi)可遺傳的變異中最常見(jiàn)的一種。SNP可由單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換(transition)或顛換(transversion)所引起,也可由堿基的插入或缺失所致。但通常所說(shuō)的SNP不包括后兩種情況。一般而言,SNP是指變異頻率大于1%的單核苷酸變異。
理論上講,每個(gè)SNP位點(diǎn)既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性,但實(shí)際上,后兩者非常少見(jiàn),幾乎可以忽略。因此,通常所說(shuō)的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(C與T、G與A,即嘧啶與嘧啶、嘌呤與嘌呤之間的轉(zhuǎn)換),也可能是顛換(C與A、G與T、C與G、A與T,即嘌呤與嘧啶之間的顛換)。轉(zhuǎn)換與顛換的發(fā)生率,二者之比為2:1。轉(zhuǎn)換的幾率之所以高,可能是因?yàn)?/span>CpG二核苷酸上的胞嘧啶殘基是人類(lèi)基因組中最易發(fā)生突變的位點(diǎn),其中大多數(shù)是甲基化的,可自發(fā)地脫去氨基而形成胸腺嘧啶。
SNP作為第三代分子遺傳標(biāo)記,與第一代的RFLP及第二代的STR以長(zhǎng)度的差異作為遺傳標(biāo)記的特點(diǎn)截然不同,SNP具有數(shù)量多、密度大、分布廣等特點(diǎn),在疾病定位和關(guān)聯(lián)分析中可以發(fā)揮極為重要的作用。
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