技術(shù)方法:
SNPscan?是由上海天昊生物科技有限公司自主專利開發(fā)的多重SNP分型專利技術(shù),能在一個檢測流程中同時實現(xiàn)對48/96/144/192個SNP位點進行分型。該技術(shù)基本原理是采用連接酶連接反應(yīng)的高特異性實現(xiàn)對SNP位點等位基因的識別,然后通過在連接探針末段引入不同長度的非特異序列以及通過連接酶加接反應(yīng)獲得位點對應(yīng)的不同長度連接產(chǎn)物,利用標記熒光的通用引物對連接產(chǎn)物進行PCR擴增,通過熒光毛細管電泳對擴增產(chǎn)物進行電泳分離,最后通過對GeneMapper軟件分析獲取各個SNP位點的基因型。
應(yīng)用領(lǐng)域:
本方法可涉及到多個需要SNP分型的遺傳研究領(lǐng)域。適合對于大量候選生物通路或者候選染色體區(qū)域的基因SNP分型,尤其適合針對全基因組SNP關(guān)聯(lián)研究獲得的初步陽性位點,以及全基因組測序得到的大量初篩突變位點進行進一步的大樣品驗證研究。
◣高準確性:檢測的準確率可達99.9%;
◣高通量:以擁有1臺ABI3730XL為例,一天可以產(chǎn)生11萬個分型數(shù)據(jù);
◣低成本:檢測成本明顯低于其他中高通量SNP分型技術(shù);
◣高成功率:位點檢出率通常達95%以上,每個位點的平均樣本檢出率可達98%以上;
◣高效性:以96個位點2000個樣本為例,實驗檢測體系構(gòu)建、優(yōu)化、檢測需8個周,及數(shù)據(jù)判讀需1個周。
◣高靈活性:可根據(jù)客戶需求進行設(shè)計合成Customer Design Panel及試劑盒,您只需擁有熒光毛細管電泳儀就可以輕松實現(xiàn)高效快速的SNP多重檢測技術(shù)。省去繁瑣的國外定制流程,更快速、更便宜。
檢測對象:
基因組DNA
服務(wù)內(nèi)容:
1. 課題的設(shè)計咨詢包括檢測位點的選取;
2. DNA樣本的質(zhì)檢與標化;
3. SNP分型所用引物的設(shè)計、合成與優(yōu)化;
4. SNPscan分型;
5. 分型數(shù)據(jù)的分析與結(jié)果報告。
檢測實例:
48個SNP位點分型截圖:
分顏色截圖(有Panel):