【昊閱讀】IF 10分的腫瘤m6A經(jīng)典研究思路分享

發(fā)稿時(shí)間：2020-01-22來(lái)源：天昊生物

從2018年-2019年的m6A相關(guān)基金已經(jīng)可以看出，短短一年多的時(shí)間，m6A的研究主題已經(jīng)從圖譜轉(zhuǎn)向機(jī)制，尤其是腫瘤，心血管，免疫，干細(xì)胞這四個(gè)領(lǐng)域，簡(jiǎn)單的圖譜已經(jīng)無(wú)法打動(dòng)基金審核的專家。圖譜+機(jī)制的組合研究方案基本上已經(jīng)是這幾個(gè)領(lǐng)域5分以上文章的標(biāo)配，今天小編就帶大家閱讀一篇眼科腫瘤的m6A文章，近期發(fā)表在Molecular Cancer雜志上，設(shè)計(jì)經(jīng)典，思路清晰，一起來(lái)學(xué)習(xí)一下10分左右m6A文章的經(jīng)典研究思路吧。

?   研究目標(biāo)：脈絡(luò)膜黑色素瘤

?   研究團(tuán)隊(duì)：上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院眼科范先群教授課題組與北京中科院基因所楊運(yùn)桂教授課題組合作

?   期刊： Molecular Cancer（IF=10.679）

主要研究結(jié)果：

除了提供m6A修飾整體水平定量，m6A圖譜測(cè)序，m6A修飾目的基因表達(dá)水平定量服務(wù)，

天昊為您的m6A研究思路做個(gè)小總結(jié)：

5分以下

思路：2個(gè)組別， RNA測(cè)序+ m6A-seq，確定m 6A整體水平差異，整體匯報(bào) m6A-seq的修飾圖譜，并且羅列差異表達(dá)基因和差異修飾基因?？赡苄枰?span>qpcr驗(yàn)證找到的差異基因。

5-8分

思路：2個(gè)組別，RNA測(cè)序+ m6A-seq，確定m6A整體水平差異，整體匯報(bào) m6A-seq的修飾圖譜，并且羅列差異表達(dá)基因和差異修飾基因。通過(guò)關(guān)鍵甲基化酶的細(xì)胞或動(dòng)物敲降或過(guò)表達(dá)，結(jié)合后續(xù)的RNA表達(dá)譜或RNAseq數(shù)據(jù)變化，來(lái)確定受m6A調(diào)控表達(dá)的靶基因list；結(jié)合pcr驗(yàn)證部分靶基因。最好有臨床數(shù)據(jù)結(jié)合分析。

10分左右

思路：除了完成基礎(chǔ)的內(nèi)容，比較關(guān)鍵是確定一個(gè)真正參與疾病，并且受m6A修飾調(diào)控的靶基因。核心內(nèi)容包括4各方面：首先要將甲基化酶敲除或者過(guò)表達(dá)，體現(xiàn)關(guān)鍵甲基化酶表達(dá)變化對(duì)疾病表型的影響；其次要通過(guò)m6A圖譜測(cè)序和RNA測(cè)序?qū)ふ乙粋€(gè)真正參與疾病，并且受m6A修飾調(diào)控的靶基因，并且后續(xù)要利用功能試驗(yàn)證明靶基因真的與m6A修飾酶結(jié)合并受m6A修飾酶調(diào)控；最后需要將靶基因敲除或者過(guò)表達(dá)，體現(xiàn)這個(gè)關(guān)鍵靶基因表達(dá)變化對(duì)疾病表型的影響。