m6A與miRNA研究案例

發(fā)稿時間：2019-08-28來源：天昊生物

文章標(biāo)題：METTL3 promote tumor proliferation of bladder cancer by accelerating pri-miR221/222 maturation in m6A-dependent manner

發(fā)表雜志：Molecular Cancer

影響因子：10.679

發(fā)表時間：2019年6月 

南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院（江蘇省人民醫(yī)院）泌尿外科呂強(qiáng)&楊海偉團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)“METTL3基于m6A修飾的方式加速pri-miR221/222成熟，從而促進(jìn)膀胱癌的腫瘤進(jìn)展”。

其實(shí)在此之前安徽醫(yī)科大學(xué)生科院團(tuán)隊已經(jīng)發(fā)現(xiàn)METTL3能夠通過AFF4/NF-κB/MYC信號通路促進(jìn)膀胱癌的進(jìn)展。

近來研究報道METTL3能夠影響一些non-coding RNA的m6A修飾，而METTL3這樣的機(jī)制在腫瘤的增殖中還鮮有報道（截止目前膀胱癌中m6A相關(guān)research文章僅有4篇！）

研究思路及主要結(jié)果

文章的整體思路如上圖，主要是為了解決以下幾個問題：

1. METTL3與膀胱癌的關(guān)系如何？METTL3體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)的表型是否一致？

2. METTL3能夠調(diào)控miRNA成熟過程，選取什么miRNA作為靶點(diǎn)？

其實(shí)本文直接參考Nature文章中的結(jié)果（N6-methyladenosine marks primary microRNAs for processing. Nature. 2015），候選的miRNA中只有miR221/222有oncogenic的角色。

3. METTL3-miR221/222的機(jī)制是否影響表型，miRNA能否rescue METTL3的影響？

4. miRNA能夠影響靶mRNA，是否存在METTL3-miR221/222-靶mRNA的機(jī)制影響膀胱癌的表型？

非編碼RNA m6A修飾研究總結(jié)

總體上來看，其實(shí)這樣的研究思路倒也不復(fù)雜，類似的文章如2019年4月林東昕院士課題組的Nature Communications文章，吸煙能夠通過m6A修飾的途徑誘導(dǎo)miR-25-3p的成熟，從而促進(jìn)胰腺癌的進(jìn)展。只不過文章中多了個上游誘導(dǎo)的因素（吸煙），主要研究內(nèi)容也是圍繞METTL3-miRNA-target mRNA展開的。

如第二軍醫(yī)大學(xué)孫樹漢教授課題組在肝癌中發(fā)現(xiàn)另外一個甲基轉(zhuǎn)移酶METTL14同樣能夠通過m6A修飾方式影響miRNA加工過程從而影響肝癌進(jìn)展，為m6A與miRNA相關(guān)的研究提供了另外一個選擇！

除這樣的思路之外，miRNA還能夠與其它發(fā)生m6A修飾的RNA（mRNA/lncRNA等）相互作用；miRNA也能夠作為上游因子影響一些靶點(diǎn)，如m6A相關(guān)的甲基轉(zhuǎn)移酶等，從而影響m6A修飾的過程。

天昊生物具有多年基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀組等多組學(xué)檢測與分析的經(jīng)驗(yàn)，m6A RNA甲基化作為表觀領(lǐng)域的一大熱點(diǎn)，天昊生物可為您提供m6A整體水平定量，結(jié)合RNA-seq和m6A MeRIP-seq挖掘潛在的受m6A調(diào)控酶影響的靶點(diǎn)，同時可對靶點(diǎn)進(jìn)行MeRIP-qPCR驗(yàn)證。生信團(tuán)隊亦可提供個性化的數(shù)據(jù)庫挖掘與生信分析內(nèi)容。

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