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2019國(guó)自然最全m6A RNA甲基化解析

發(fā)稿時(shí)間:2019-08-24來(lái)源:天昊生物

一年一度的國(guó)自然基金資助項(xiàng)目于上周放榜,各大平臺(tái)陸續(xù)開(kāi)始解析國(guó)自然項(xiàng)目?jī)?nèi)容m6A RNA甲基化作為近三年來(lái)最火熱的研究方向之一,國(guó)自然今年立項(xiàng)數(shù)目更是呈爆發(fā)式增長(zhǎng),天昊生物市場(chǎng)部從多個(gè)關(guān)鍵詞入手,發(fā)現(xiàn)2019m6A RNA甲基化項(xiàng)目共計(jì)179項(xiàng),比2018年增長(zhǎng)了一倍之多。

 

從項(xiàng)目類(lèi)型劃分,重點(diǎn)項(xiàng)目3項(xiàng),面上項(xiàng)目89項(xiàng),青年基金81項(xiàng),地區(qū)基金6項(xiàng)。

 

 

其中部分老師在相應(yīng)的領(lǐng)域已經(jīng)有m6A相關(guān)的重要成果發(fā)表:

 

 

 

從科研單位劃分,共計(jì)76個(gè)單位拿到了資助項(xiàng)目,中山大學(xué)在m6A領(lǐng)域仍然獨(dú)占鰲頭,拿到了20項(xiàng),南京醫(yī)科大學(xué)以17項(xiàng)占據(jù)次席,上海交通大學(xué)9項(xiàng),華中科技大學(xué)7項(xiàng),浙江大學(xué)6項(xiàng),武漢大學(xué)6項(xiàng),中南大學(xué)6項(xiàng),哈爾濱醫(yī)科大學(xué)5項(xiàng),同濟(jì)大學(xué)5項(xiàng),鄭州大學(xué)5項(xiàng)。

中山大學(xué)在國(guó)內(nèi)一直是m6A修飾表觀(guān)領(lǐng)域的領(lǐng)跑者,作為第一單位或合作單位,2019年以來(lái)就有近26篇文章發(fā)表,其中包括1Nature (Histone H3 trimethylation at lysine 36 guides m6A RNA modification co-transcriptionally),1Cell Research (Transcriptome-wide reprogramming of N6-methyladenosine modification by the mouse microbiome)1Science Advances (Single-base mapping of m6A by an antibody-independent method),2Nature Communications3Molecular Cancer

 

 

從研究方向劃分,絕大多數(shù)項(xiàng)目都是與醫(yī)學(xué)(健康或疾病)相關(guān),農(nóng)口相關(guān)的項(xiàng)目?jī)H10項(xiàng)。醫(yī)學(xué)疾病領(lǐng)域,腫瘤仍然是最主要的方向,約77項(xiàng),最常見(jiàn)的包括肺癌、肝癌、胃癌、乳腺癌和結(jié)直腸癌等。研究的主要內(nèi)容包括m6A修飾如何影響腫瘤的發(fā)生、增殖、轉(zhuǎn)移、耐藥等。

 

 

其它主要的疾病方向包括心血管疾病(動(dòng)脈粥樣硬化、心肌梗死、心肌肥大、心肌炎癥等共15項(xiàng),部分如下圖)、神經(jīng)脊髓相關(guān)11項(xiàng))、骨相關(guān)9項(xiàng))、糖尿病7項(xiàng))、胚胎發(fā)育分化7項(xiàng))、孕期疾病4項(xiàng))、肺部疾病3項(xiàng))、脂肪代謝3項(xiàng))、腎臟疾病3項(xiàng))、膿毒癥2項(xiàng))、銀屑病2項(xiàng))等。

 

 

從研究思路上看,今年m6A RNA甲基化最大的特點(diǎn)是非編碼RNA相關(guān)的內(nèi)容大幅增加,醫(yī)學(xué)相關(guān)共計(jì)47項(xiàng)!其中主要包括三個(gè)研究方向:

1. lncRNAcircRNA本身的m6A修飾

2. m6A修飾影響miRNA的成熟過(guò)程(primary miRNAm6A修飾)

3. 非編碼RNA作為上游因子調(diào)控m6A修飾相關(guān)的明星分子,從而影響某些mRNA的修飾

 

 

比如m6A修飾影響miRNA的成熟過(guò)程,得益于2015年兩項(xiàng)重要的奠基性的成果,1Nature1Cell分別證實(shí)了m6A修飾能夠影響miRNA的加工成熟過(guò)程以及發(fā)現(xiàn)了pri-miRNA m6A修飾的reader蛋白HNRNPA2B1

 

 

2019年以來(lái)國(guó)內(nèi)學(xué)者在非編碼RNA m6A修飾相關(guān)方向也有一些重要成果,如林東昕院士課題組發(fā)現(xiàn)吸煙能夠通過(guò)m6A修飾的途徑誘導(dǎo)miR-25-3p的成熟,從而促進(jìn)胰腺癌的進(jìn)展,相關(guān)成果于20194月發(fā)表在Nature Communications上。

 

 

如中山大學(xué)藥學(xué)院王紅勝課題組發(fā)現(xiàn)m6A修飾的lncRNA RP11能夠通過(guò)翻譯后上調(diào)Zeb1蛋白的表達(dá)促進(jìn)結(jié)直腸癌的進(jìn)展,表明lncRNA的甲基化可能在結(jié)直腸癌中發(fā)揮重要作用,相關(guān)研究成果發(fā)表在20194月的Molecular Cancer上。

 

 

總結(jié):3年來(lái)m6A RNA甲基化修飾在疾病相關(guān)的各個(gè)領(lǐng)域都有新的重要的發(fā)現(xiàn),m6A修飾確實(shí)參與到多種疾病的發(fā)生發(fā)展過(guò)程,而調(diào)控m6A修飾的因素眾多,包括多種甲基化修飾酶(writers)、去甲基化修飾酶(erasers)、甲基化修飾識(shí)別蛋白(readers)、影響這些酶的上游因子等,同時(shí)各種RNA都有可能發(fā)生m6A修飾。因此RNA甲基化方向可以設(shè)計(jì)多種多樣的方案,特別適合于國(guó)自然機(jī)制研究的胃口

 

 

關(guān)于天昊

天昊生物具有多年基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀(guān)組等多組學(xué)檢測(cè)與分析的經(jīng)驗(yàn),m6A RNA甲基化作為表觀(guān)領(lǐng)域的一大熱點(diǎn),天昊生物可為您提供m6A整體水平定量,結(jié)合RNA-seqm6A MeRIP-seq挖掘潛在的受m6A調(diào)控酶影響的靶點(diǎn),同時(shí)可對(duì)靶點(diǎn)進(jìn)行MeRIP-qPCR驗(yàn)證。生信團(tuán)隊(duì)亦可提供個(gè)性化的數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘與生信分析內(nèi)容。

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