哮喘、花粉熱(或過敏性鼻炎)和濕疹(或特異反應(yīng)性皮炎)經(jīng)常在個(gè)體身上同時(shí)發(fā)生,部分原因是它們具有共同的遺傳來源。為了鑒定這些共同的遺傳變異,研究者對(duì)具有至少一種以上上述廣泛過敏性疾病表型的個(gè)體進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS;n = 360838)。最終,研究者發(fā)現(xiàn)136個(gè)獨(dú)立的風(fēng)險(xiǎn)變異(P<3×10-8),其中的73個(gè)尚未報(bào)道過,暗示了附近的132個(gè)基因可能與過敏性疾病有關(guān)。疾病特異性作用變異位點(diǎn)只檢測(cè)到6個(gè),這也證實(shí)了大多數(shù)位點(diǎn)具有共有的風(fēng)險(xiǎn)因素。組織特異性遺傳和生物過程富集分析表明共有的風(fēng)險(xiǎn)變異影響了淋巴細(xì)胞介導(dǎo)的免疫。6個(gè)目標(biāo)基因?yàn)樗幬镏匦露ㄎ惶峁┝藱C(jī)會(huì),36個(gè)基因CpG甲基化可以作為獨(dú)立遺傳效應(yīng)影響轉(zhuǎn)錄。哮喘、花粉熱和濕疹因?yàn)楣蚕泶罅窟z傳風(fēng)險(xiǎn)變異,造成免疫相關(guān)基因表達(dá)失調(diào),最終產(chǎn)生了疾病的部分共存現(xiàn)象。
研究背景:
哮喘、花粉熱和濕疹三種過敏性疾病往往相伴而生,但是其致病的遺傳原因仍然不十分清楚。
研究對(duì)象:
從UK Biobank、1000G數(shù)據(jù)庫以及23andMe公司獲得的表型和基因型數(shù)據(jù)。
研究方法:
全基因組關(guān)聯(lián)分析
研究流程:
研究結(jié)果:
圖1、與過敏性疾病風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)的136個(gè)遺傳風(fēng)險(xiǎn)變異位點(diǎn)(P<3×10-8)
表1、新發(fā)現(xiàn)的相關(guān)位點(diǎn)舉例列表
圖2、6個(gè)疾病特異性作用變異位點(diǎn)(黃色三角)。例如,rs61816761[A] 等位基因變異在濕疹中是在花粉熱中的1.32倍。rs2228145(黑色三角)表明在三種疾病中等位基因頻率沒有變化。
圖3、過敏性風(fēng)險(xiǎn)變異影響的組織及生物過程
根據(jù)圖3可見,這些變異主要影響血液和肺中的基因表達(dá),并且在胞外信號(hào)誘導(dǎo)自噬的生物過程得到富集。
表2、潛在可行的過敏性疾病藥物及目標(biāo)基因列表
根據(jù)本研究結(jié)果,研究者發(fā)現(xiàn)了29個(gè)基因可能用于后續(xù)靶向藥物開發(fā),這些可能用于過敏性疾病治療(表2),為藥物重新定位提供理論支持。
結(jié)論: