南京農(nóng)業(yè)大學食品科學與技術學院近期在《Journal of Agricultural and Food Chemistry》上發(fā)表了苦丁茶中二咖啡??鼘幩釋δc道微生態(tài)調(diào)節(jié)作用的文章。在恭喜天昊生物客戶發(fā)表微生物文章同時,我們想跟大家分享一下文章的研究思路。
英文題目:Modulating Effects of Dicaffeoylquinic Acids from Ilex Kudingcha on Intestinal Microecology in vitro
中文題目:苦丁茶中二咖啡??鼘幩釋δc道微生態(tài)的調(diào)節(jié)作用
期刊名:Journal of Agricultural and Food Chemistry
發(fā)表時間: 2017年10月 影響因子: 3.1540
材料方法:
實驗設計
體外發(fā)酵實驗共包含11組:一組不加碳水化合物(BLK)和四組包含不同碳水化合物(Glu,SUC,GOS和INL);一個原始狀態(tài)組(OR)和五組添加苦丁茶二咖啡??鼘幩幔╠iCQAs)。
材料與試劑
苦丁茶、葡萄糖(Glu)、蔗糖(SUC)、菊粉(INL)、糖麻(GOS)、乙酸、丙酸、n-butyric、i-butyric、n-valeric、i-valeric、2-ethylbutyric acids、甲醇、甲酸。
diCQAs制備
苦丁茶diCQAs根據(jù)報道方法進行一些修改:苦丁茶用熱水提取,產(chǎn)生的輸液過濾,冷卻至室溫,裝上大孔樹脂柱吸附,用紫外分光光度計在線監(jiān)測柱,用純水洗脫,直到出水在325 nm處不吸收,用乙醇溶液(70%,v/v)洗脫目標部位,收集出水真空濃縮、冷凍凍干。
體外厭氧發(fā)酵
使用糞便微生物體外厭氧發(fā)酵的方法來調(diào)查diCQAs對腸道菌群的影響。糞便樣品從4名健康志愿者獲得(2名男性和2名女性,22 - 28歲),沒有任何胃腸道疾病或在過去的3個月沒服用任何抗生素、益生菌、益生元、瀉藥。將糞便樣品混合在一起,用蒸壓生理鹽水溶液稀釋10次,得到10%(w/v)懸浮液。懸浮液離心4℃,而上清液用于下面發(fā)酵的糞漿。準備基礎營養(yǎng)生長培養(yǎng)基,葡萄糖(Glu)、蔗糖(SUC)、菊粉(INL)、糖麻(GOS)(10 g/L)分別添加到培養(yǎng)基中。微生物發(fā)酵系統(tǒng)由2毫升糞漿和18毫升培養(yǎng)基組成。不添加diCQAs含葡萄糖、蔗糖,糖麻、菊粉、不加任何碳水化合物分別定義為GLU, SUC, GOS, INL,BLK;而添加diCQAs (1.0 g/L) 含葡萄糖、蔗糖,糖麻、菊粉、不加任何碳水化合物分別定義為GLUD, SUCD, GOSD, INLD, BLKD。每個體外發(fā)酵試驗包含3個生物學重復。發(fā)酵系統(tǒng)在MGC缺氧密閉系統(tǒng)進行,37℃孵育24 h。每6小時輕輕搖動,使發(fā)酵系統(tǒng)盡可能均勻。培養(yǎng)后,采樣用于細菌DNA提取,凍在20℃用于SCFA分析。
Miseq測序
細菌測序區(qū)段為:(V4)
研究結(jié)果:
厭氧發(fā)酵后菌群的豐富度和多樣性。
33個樣本的平均測序數(shù)據(jù)量(clean data)為43029 ± 6733 序列。共檢測到316 個OTUs,平均每個樣本檢測到160 ± 21 OTUs。稀釋性曲線和Shannon曲線表明大多數(shù)物種被檢測到(圖1)。
圖1 所有樣本的稀釋性曲線(a)和香農(nóng)指數(shù)曲線(b)。
α多樣性指數(shù)如表1所示:INL組微生物多樣性最低,而BLK組微生物多樣性最高。與不添加diCQAs組相比,添加苦丁茶diCQAs增加了α多樣性。無碳水化合物培養(yǎng)時,diCQAs添加會降低微生物多樣性(與BLK相比,BLKD的Shannon指數(shù)更低,而Simpson指數(shù)更高)。據(jù)報道,腸道菌群多樣性與宿主健康密切相關,肥胖個體腸道微生物多樣性顯著低于瘦肉型個體,Shannon指數(shù)與脂肪組織呈顯著負相關。本研究結(jié)果表明:diCQAs能增加腸道菌群多樣性,表明苦丁茶的diCQAs具有通過調(diào)節(jié)腸道菌群抵抗肥胖的能力。
表1 各組α多樣性指數(shù)分析
diCQAs對整體微生物結(jié)構(gòu)影響
圖2 OTUs水平微生物的聚類分析(a)、熱圖分析(b)、NMDS分析(c)、CCA分析(d)。
門和屬水平微生物群落組成
圖3門水平微生物組成(A、群落結(jié)構(gòu)柱狀圖;B、厚壁菌門的相對豐度;C、擬桿菌門的相對豐度;D、厚壁菌門/擬桿菌門(F / B)比例;E、放線菌門的相對豐度)。
屬水平微生物組成圖顯示(圖4),DiCQAs可以增加碳水化合物發(fā)酵組中Bacteroides(擬桿菌), Bifidobacterium(雙歧桿菌)和 Escherichia/Shigella(大腸桿菌/志賀菌)的豐度,同時降低Prevotella(普氏菌), Megamonas(巨單胞菌), Dialister(嗜血桿菌),Anaerostipes豐度。值得注意的是,GOSD組雙歧桿菌的豐度高于GOS組和其它DiCQAs添加組,表明α- GOS和DiCQAs可協(xié)同促進雙歧桿菌增殖。
圖4 屬水平上的微生物組成(A、群落結(jié)構(gòu)柱狀圖;B、熱圖)。
DiCQAs對微生物組成差異的影響
LEfSe分析顯示在葡萄糖、蔗糖、糖麻和菊粉存在情況下,添加diCQAs可以分別增加20, 17, 20和22個屬豐度(其中有14個屬是組間共有),也可以分別減少10,10,11,8個屬豐度(其中有6個屬是組間共有)(圖5)。
圖5 屬水平上的LEfSe分析(A, GLU vs. GLUD; B, SUC vs. SUCD; C, GOS vs. GOSD; D, INL vs. INLD)。
把無diCQAs組(GLU, SUC, GOS, INL)定義為C群,diCQAs添加組(GLUD, SUCD, GOSD, INLD)定義為CD群。C群和CD群的差異趨勢與上面不同碳水化合物條件得到的比較結(jié)果一致。在門水平,CD組比C組具有較高豐度的放線菌門和變形菌門,而厚壁菌門在C組更常見。在綱水平,添加diCQAs減少了Negativicutes豐度, 增加了放線菌綱,芽孢桿菌綱,γ-變形菌綱,α-變形菌綱豐度。在科水平,添加diCQAs增加了雙歧桿菌科等12個物種豐度,同時抑制了Sreptococcaceae, Prevotellaceae,Veillonellaceae等物種豐度。很顯然,diCQAs表現(xiàn)出對雙歧桿菌增殖顯著的正效應。而雙歧桿菌是一種被廣泛研究的益生菌,它能降低肥胖的風險和發(fā)生率,其豐度與肥胖者內(nèi)毒素水平呈負相關。其促進健康的機制涉及多種作用,如粘附到腸上皮細胞,產(chǎn)生有益的代謝產(chǎn)物,增強腸道屏障,調(diào)節(jié)免疫反應,以及競爭性排斥病原體。
圖6 無diCQAs組(C)和diCQAs添加組(CD)屬水平上的LEfSe分析。
diCQAs對短鏈脂肪酸(SCFA)的影響
大腸是人類產(chǎn)生短鏈脂肪酸的主要場所,棲息在那里的腸道微生物起著至關重要的作用。有機酸,包括乳酸、丙酮酸和乙酸,都來自碳水化合物的發(fā)酵,也可以由微生物進一步轉(zhuǎn)化為丙酸和丁酸。短鏈脂肪酸對維持人體健康具有多功能,并能保護腸黏膜屏障,降低炎癥反應水平,刺激腸胃蠕動。丁酸是一種重要的微生物代謝產(chǎn)物,它是結(jié)腸上皮細胞的主要能量來源,具有調(diào)節(jié)宿主基因表達,細胞分化和凋亡的功能。乙酸能促進腸粘液分泌,丙酸可能在調(diào)節(jié)食欲方面起關鍵作用。
本文短鏈脂肪酸(SCFA)分析結(jié)果如表2所示,在所有的短鏈脂肪酸中,乙酸,丙酸和乳酸是最豐富的有機酸,丁酸也占一定比例。在無任何碳水化合物條件下,diCQAs抑制所有有機酸(除乳酸)和總酸,例如在它們的濃度在BLKD組中較BLK組低。在任何碳水化合物條件下,添加diCQAs可促進乙酸和乳酸產(chǎn)生,例如 (GLUD, SUCD, GOSD)組較(GLU, SUC, GOS)組多;添加diCQAs可減少丙酸和n-butyric(正丁酸)的含量。此外,BLK組的i-butyric, n-butyric,i-valeric 濃度最高。
表2 短鏈脂肪酸、乳酸和總酸的濃度
總結(jié):
膳食多酚已被視為新的益生元,多酚可以通過調(diào)節(jié)腸道菌群發(fā)揮作用。苦丁茶的多種生物活性可能來源于它的酚類化合物,但苦丁茶中二咖啡酰奎尼酸(diCQAs)對腸道菌群的影響目前沒有被調(diào)查過。研究發(fā)現(xiàn)diCQAs可以提高微生物多樣性,并且diCQAs對微生物的影響高于碳水化合物(葡萄糖、蔗糖、糖麻和菊粉)對微生物的影響。添加DiCQAs可以增加擬桿菌、雙歧桿菌、梭狀芽孢桿菌、志賀氏菌等菌相對豐度,降低瘤胃球菌,小桿菌,巨型球菌等菌相對豐度。DiCQAs也可以通過微生物影響了短鏈脂肪酸的產(chǎn)生,例如乙酸和乳酸含量增加,丙酸和丁酸生成減少??偟膩碚f,苦丁茶中的二咖啡??崴幔?/span>diCQAs)在體外對腸道菌群有顯著的調(diào)節(jié)作用,這表明diCQAs具有被開發(fā)成功能性食品的潛力,通過促進腸道健康預防疾病的發(fā)生。
關于天昊:
天昊生物采用Miseq PE250測序策略對細菌16S rDNA區(qū)/真菌ITS區(qū)/真菌18S rDNA區(qū)的雙V區(qū)或多種單V區(qū)進行測序,使用低循環(huán)數(shù)擴增,保證每個樣品擴增的循環(huán)數(shù)統(tǒng)一;采用特殊方法可有效避免系統(tǒng)內(nèi)誤差;數(shù)據(jù)質(zhì)量高,有效序列Q30達到90%以上;加上最新升級的分析內(nèi)容和解釋詳盡的結(jié)題報告,帶您享受極致的微生物擴增子測序體驗。