副標(biāo)題:四管齊下:宏基因組+代謝組+糞菌移植+擴增子測序!
英文題目:Gut microbiota dysbiosis contributes to the development of hypertension
中文題目:腸道菌群失調(diào)導(dǎo)致高血壓的發(fā)生
期刊名:Microbiome 發(fā)表時間: 2017 影響因子: 8.496
發(fā)表單位:中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院阜外醫(yī)院高血壓中心
技術(shù):
l 宏基因組測序(GM) :41名對照者(Control)、56例高血壓前期患者(pHTN)、99例原發(fā)性高血壓患者(HTN)的糞便樣本
l 代謝組(LC/MS):30名對照者(Control)、31例高血壓前期患者(pHTN)、63例原發(fā)性高血壓患者(HTN)的空腹全血樣本
l 糞便移植無菌小鼠: 對照組小鼠n=5、HTN組小鼠n=10
l 受體小鼠糞便16S rRNA擴增子測序(V4)
篩選標(biāo)準(zhǔn):所有高血壓患者都是最新診斷的高血壓患者,并且都沒進行過降壓治療。有癌癥、心力衰竭、腎衰竭、吸煙、中風(fēng)、外周動脈疾病和慢性炎癥性疾病的患者被排除。不能使用以下藥物,包括他汀類藥物、阿司匹林、胰島素、二甲雙胍、硝苯地平和美托洛爾。過去8周內(nèi)不能接受抗生素或益生菌治療。除了收縮壓和舒張壓外,其它臨床參數(shù)在患者和對照者之間均無顯著性差異(除了空腹血糖水平有差異)。
研究背景:
最近,腸道微生物在代謝性疾病中的作用已經(jīng)顯露出來,尤其是在心血管疾病。高血壓是世界范圍內(nèi)最常見的心血管疾病之一,然而腸道菌群失調(diào)是否參與高血壓的發(fā)生發(fā)展仍然是未知的。為了探討這個問題,本文對健康對照者、高血壓前期患者、原發(fā)性高血壓患者進行了全面的宏基因組學(xué)和代謝組學(xué)分析,并將高血壓患者糞便菌群移植到無菌小鼠,觀察其是否出現(xiàn)高血壓癥狀。
研究結(jié)果:
1、 微生物多樣性和腸型分析
稀釋性曲線結(jié)果表明所測數(shù)據(jù)量已經(jīng)足夠發(fā)現(xiàn)絕大多數(shù)基因。對照組新基因速率超過疾病組新基因獲取速率,提示高血壓前期患者(pHTN)和原發(fā)性高血壓患者(HTN)的基因豐富相對較低(圖1A)。與對照組相比,PHTN和HTN組的基因數(shù)量顯著性減少(圖1B)。在屬水平PHTN和HTN組的腸道菌群a多樣性顯著降低(圖1C)。這些結(jié)果表明高血壓患者腸道菌群減少。
196個樣本分可以為兩個不同的腸型(圖1D):腸型1(Prevotella)和腸型2(Bacteroides). PHTN和HTN組具有更多比例的Prevotella腸型,而健康對照組具有更多比例的Bacteroides腸型(圖1F)。
圖1. 高血壓患者微生物多樣性降低,腸型發(fā)生轉(zhuǎn)化
2、 與高血壓相關(guān)的菌屬
44個菌屬在組間存在差異(圖2A)。Prevotella和Klebsiella菌在PHTN和HTN組中顯著增加(圖2B)。Prevotella起源于口腔和生殖道,牙周病和風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎與Prevotella相關(guān)。許多傳染病認為是Klebsiella造成的。相比之下,Faecalibacterium, Oscillibacter, Roseburia,Bifidobacterium, Coprococcus, Butyrivibrio在健康人群富集(圖2B)。Faecalibacterium(柔嫩梭菌)和Roseburia(羅斯氏菌)豐度下降已知與克隆氏氏病和潰瘍性結(jié)腸炎發(fā)生相關(guān),這兩種細菌都是丁酸生產(chǎn)的關(guān)鍵菌。這表明Prevotella和Klebsiella菌的過度生長可能在高血壓的病理中起重要作用。同時需要注意的是,高血壓前期組(PHTN)已經(jīng)具有與高血壓組(HTN)類似的微生物群落。這表明腸道菌群變化可能早于高血壓的形成。
圖2. 各組間的差異菌屬分析
3、 PHTN和HTN組中顯著富集的CAG
與對照相比,分別有316和372個CAG在PHTN和HTN組得到富集。對照組中顯著富集的CAG主要來自Firmicutes和Roseburia(圖3A,B);PHTN組富集的CAG主要來自Enterobacter(腸桿菌,一種與肥胖有關(guān)的致病細菌);隸屬于Fusobacterium和Klebsiella的CAG在PHTN和HTN組得到富集。
圖3. 與對照相比,上調(diào)或下調(diào)菌類型的相關(guān)網(wǎng)絡(luò)分析。CAG為至少包含50個連鎖基因的基因簇。節(jié)點的大小表示該CAG的基因數(shù)量。節(jié)點的顏色代表了它們所屬分類。斯皮爾曼相關(guān)系數(shù)值大于0.8用紅色線段連接,0.7-0.8用灰色線段連接。
4、 臨床指標(biāo)與CAG細菌相關(guān)性分析
將臨床指標(biāo)包括收縮壓(SBP)、舒張壓(DBP)、體重指數(shù)(BMI)、空腹血糖(FBG)、總膽固醇(TC)、甘油三酯(TG)和低密度脂蛋白(LDL)與CAG進行Spearman相關(guān)分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn):SBP和DBP可以負調(diào)控對照組富集的CAG(例如Firmicutes、Roseburia),可以正調(diào)控pHTN和HTN組富集的Prevotella和Desulfovibrio。而TC和TG與pHTN和HTN組富集的Enterobacter呈負相關(guān)(圖S6)。這些結(jié)果表明PHTN和HTN組的細菌群落很相似,這些細菌的集體效應(yīng)可能與
高血壓患者的腸道微生態(tài)失調(diào)相關(guān)。表明PHTN和HTN組的細菌群落很相似,這些細菌的集體效應(yīng)可能與高血壓患者的腸道微生態(tài)失調(diào)相關(guān)。
圖S6. 臨床指標(biāo)與CAG豐度相關(guān)性分析。正相關(guān)用紅色表示,負相關(guān)用藍色表示,+: p值<0.01;*: p值<0.05。
5、 PHTN和HTN組菌群功能的改變
健康組和高血壓組在腸道菌群基因功能上具有明顯差異(圖4A)。無論是KEGG modules(圖4B)還是碳水化合物活性酶類(圖4C),與對照組相比,PHTN和HTN組都有類似的差異,說明PHTN和HTN組腸道菌群功能很類似。39個KEGG modules在PHTN和HTN組減少,主要包括:支鏈氨基酸的合成運輸、酮體生物合成、雙組分調(diào)節(jié)系統(tǒng)、甲硫氨酸和嘌呤降解(圖4B),這些代謝功能對宿主是必不可少的。17個KEGG modules在PHTN和HTN組升高,主要包括:LPS合成運輸、磷脂運輸、磷酸轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)(PTS)、
苯丙氨酸和磷脂酰乙醇胺合成、分泌系統(tǒng)(圖4B)。PHTN和HTN組的纖維素結(jié)合結(jié)構(gòu)域相關(guān)基因顯著富集但是glycan-utilizing enzymes相關(guān)基因顯著減少(圖4C)。
圖4 PHTN和HTN組微生物基因功能注釋。 A.196個樣品KEGG Orthology相對豐度比較。 B.各組間腸道微生物KEGG modules的差異比較。C. 各組間腸道微生物CAZy家族豐度的差異比較。
6、 各組間腸道菌群代謝物比較分析
因為腸道菌群的代謝產(chǎn)物可以進入血液并可以影響宿主的生理機能,利用LC/MS對124個樣本的血清進行代謝物分析,進而對腸道菌群和代謝物進行相關(guān)性分析。PLS-DA分析能把代謝物在健康組、PHTN和HTN組明顯分開(圖5A、B),其中PHTN和HTN組的腸道菌群代謝產(chǎn)物非常類似。對照組和PHTN共有167個代謝物有差異,對照組和HTN組共有215個代謝物有差異(圖5C)。值得注意的是,PHTN和HTN組的代謝產(chǎn)物變化非常類似,這與前面的腸道菌群變化緊密相關(guān)(圖5D)。3,4,5-三甲氧基肉桂酸、溶血磷脂酰膽堿(LysoPC)、S-羧甲基-L-半胱氨酸和溶血磷脂酰乙醇胺(LysoPE)在PHTN和HTN組明顯減少。N-乙酰- L -精氨酸α、硬脂酸、磷脂酸(PA)和葡萄糖苷在在PHTN和HTN組明顯增多。微生物菌群與代謝產(chǎn)物有相關(guān)性:對照組富集的三氯葡萄糖醛酸與Bifidobacterium、Akkermansia正相關(guān),但是與Prevotella呈負相關(guān)。HTN組富集的Klebsiella、Prevotella、 Enterbacter與硬脂酸呈正相關(guān),而硬脂酸與Bifidobacterium、Roseburia呈負相關(guān)。
圖5 PHTN和HTN組的異常代謝模式。 A.不同組別血清代謝譜的PLS-DA分析。 B. 不同組別血清代謝譜的散點圖分析。 C. 在PHTN和HTN組發(fā)生明顯變化的代謝物。ES +:離子模式,ES?:負離子模式。D.不同組別血清代謝產(chǎn)物的差異比較。E. 26種內(nèi)源性代謝物與44個菌屬的Spearman相關(guān)性分析。對照組:綠色,高血壓組:粉紅色。
7、 建立識別高血壓病人的的診斷模型
建立了基于CAG和代謝物的高血壓疾病診斷模型,此診斷模型可以準(zhǔn)確區(qū)分高血壓患者和健康人,AUC值分別為0.91,表明此模型很準(zhǔn)確(圖6A),另外此診斷模型也可以準(zhǔn)確區(qū)分高血壓前期患者和健康人,AUC值分別為0.89(圖6B)。此模型不能有效區(qū)分PHTN和HTN組(圖6C)。PHTN和HTN組區(qū)別與對照組的一些CAG是共同的:例如CAG-172 (Prevotella), CAG-197(Prevotella), CAG-759 (Faecalibacterium), CAG-765(Faecalibacterium), and CAG-793 (Faecalibacterium) (圖6D、E)
圖6 建立了從對照組準(zhǔn)確區(qū)分高血壓前期和高血壓患者的疾病分類器
8、 糞便移植可以導(dǎo)致血壓升高
在這項研究中,似乎高血壓的主要原因是腸道微生態(tài)失調(diào),因此,本文想研究是否可以通過微生物移植來改變血壓。因此把高血壓患者的糞便移植到無菌小鼠體內(nèi),來看看這些無菌小鼠的反應(yīng)。本研究的微生物移植供體包括兩例高血壓患者和正常血壓對照者。8~10周的小鼠分為兩組(對照組n=5, HTN組n=10 ),分別口服接種供體糞便樣本(圖7A)。喂養(yǎng)7天后使用通過16S擴增子測序研究受體小鼠的糞便樣品。從高血壓患者成功定植到無菌小鼠128個菌屬。從健康對照者成功定植到無菌小鼠110個菌屬(圖7B)。香濃指數(shù)表明HTN組小鼠細菌多樣性少(圖7C)。PCoA分析表明高血壓患者和對應(yīng)受體小鼠菌群結(jié)構(gòu)類似,而對照健康人和對應(yīng)受體小鼠的菌群結(jié)構(gòu)類似(圖7D)。屬水平上,Anaerotruncus, Coprococcus, Ruminococcus, Clostridium, Roseburia, Blautia, Bifidobasterium在HTN組小鼠較少(圖7E),而Coprobacillus和Prevotella則在HTN組小鼠富集,這與前面的人宏基因組分析結(jié)果一致。移植后10周,與對照組相比,移植了HTN糞便的小鼠表現(xiàn)出顯著較高的收縮壓(SBP),舒張壓(DBP)和平均血壓(MBP)(圖7F)。
圖7糞便移植后的受體小鼠腸道微生物分布及血壓統(tǒng)計。
總結(jié):
l 與健康對照者相比,PHTN和HTN組的微生物豐富度和多樣性顯著下降。
l PHTN和HTN組具有更多比例的Prevotella腸型。
l PHTN和HTN組中有益菌明顯降低、Prevotella和Klebsiella等有害菌過度生長。
l PHTN和HTN組中與疾病相關(guān)的微生物功能和基因顯著富集。
l PHTN和HTN組的微生物和代謝產(chǎn)物變化非常相似,表明PHTN和HTN組的代謝產(chǎn)物改變與微生物組的改變密切相關(guān)。
l 建立了基于菌群和代謝物的疾病診斷模型,能準(zhǔn)確區(qū)分對照組和高血壓前期、高血壓患者。
l 將高血壓患者糞便移植到無菌小鼠,結(jié)果無菌小鼠血壓升高。