[文獻(xiàn)匯總]與銀屑病相關(guān)的微生物群落研究

發(fā)稿時(shí)間：2017-06-20來源：天昊生物

 

銀屑病俗稱牛皮癬，是一種常見的慢性復(fù)發(fā)性炎癥性皮膚病，根據(jù)皮損的特點(diǎn)，臨床上銀屑病分為四種類型，即尋常型、關(guān)節(jié)病型、紅皮病型和膿皰型。近來來，越來越多的科學(xué)家開始研究銀屑病相關(guān)微生物研究，今天，我們就盤點(diǎn)一下有關(guān)銀屑病微生物群落的研究成果吧！

 

案例1   正常人和銀屑病患者皮膚細(xì)菌菌群的比較

 

中文題目：正常人和銀屑病患者皮膚細(xì)菌菌群的比較

英文題目： Comparison of bacterial microbiota in skin biopsies from normal and psoriatic skin發(fā)表雜志：Arch Dermatol Res

發(fā)表時(shí)間：2012    

研究對(duì)象：10名銀屑病患者和12名健康對(duì)照組不對(duì)等部位的活檢組織樣本；

技術(shù)方法：細(xì)菌16S rDNA擴(kuò)增子測(cè)序，V3-V4區(qū)；

研究平臺(tái)：Roche 454-FLX GS-l00；

研究結(jié)果：

l  共鑒定到19個(gè)門和652個(gè)OTU。

l  在正常組和銀屑病組最常見的三個(gè)門分別是厚壁菌門，變形菌門和放線菌門。

l  在正常組和銀屑病組最常見的屬是鏈球菌屬。

l  在軀干的皮膚，與對(duì)照組相比，銀屑病患者的變形菌門比例顯著升高，與對(duì)照組相比，在銀屑病患者中葡萄球菌和丙桿酸菌比例降低。

圖3 所有樣品門水平群落結(jié)構(gòu)柱狀圖。C1–C13健康組，P14–P23銀屑病組

案例2  銀屑病患者皮膚菌群的分化

 

中文題目：銀屑病患者皮膚菌群的分化

英文題目： Community differentiation of the cutaneous microbiota in psoriasis

發(fā)表雜志：Microbiome

發(fā)表時(shí)間：2013    

研究對(duì)象：銀屑病患者皮損的皮膚（病變組），健康對(duì)照者位置相匹配的皮膚（對(duì)照組），銀屑病患者身體對(duì)側(cè)沒有影響的皮膚（無影響組），共51個(gè)組；

技術(shù)方法：細(xì)菌16S rDNA擴(kuò)增子測(cè)序，V1-V3區(qū)；

研究平臺(tái)：Roche 454-FLX；

研究結(jié)果：

l  微生物多樣性在對(duì)照組、無影響組、病變組依次減少。

l  與對(duì)照組相比，病變組和未受影響組群落豐富度和均勻度均降低。

l  PCoA分析顯示病變組和其它兩組的菌群結(jié)構(gòu)截然不同。

l  與對(duì)照組相比，病變組在嗜銅雷氏菌屬, 玫瑰彎菌屬, 甲基桿菌屬, 水生施萊格爾氏菌等四種菌屬上豐度降低。

l  皮膚菌群可以分為兩個(gè)不同的集群，稱之為cutaneotypes：（1）變形菌門相關(guān)微生物；（2）厚壁菌門和放線菌門相關(guān)微生物，其中第2種類型菌在病變組比例相對(duì)于對(duì)照組較高。

圖4 銀屑病相關(guān)cutaneotypes證據(jù)

案例3  皮膚菌群受銀屑病和特應(yīng)性皮炎影響

 

中文題目：皮膚表皮菌群受銀屑病和特應(yīng)性皮炎影響

英文題目： Skin microbiota of first cousins affected by psoriasis and atopic dermatitis

發(fā)表雜志：Clin Mol Allergy

發(fā)表時(shí)間：2016    

研究對(duì)象：挑選了三個(gè)堂兄弟作為研究對(duì)象：一個(gè)受中度特異性皮炎影響，一個(gè)患銀屑病，一個(gè)為健康對(duì)照組；使用刮匙在左耳后面2厘米區(qū)域采集兩個(gè)皮損和兩個(gè)非皮損區(qū)樣本（銀屑病和特應(yīng)性皮炎），使用刮匙在左耳后面的2厘米區(qū)域采集樣本（健康組）；

技術(shù)方法：細(xì)菌16S rDNA擴(kuò)增子測(cè)序；

研究平臺(tái)：Ion torrent PGM平臺(tái)；

研究結(jié)果：

l  銀屑病組的厚壁菌豐度減少和變性菌門豐度增加。

l  與特異性皮炎組和健康組相比，銀屑病組的鏈球菌科, 紅桿菌科, 螺桿菌科，莫拉菌科豐度增加。

l  特異性皮炎組比銀屑病組和健康受試者具有更大豐度的金黃色葡萄球菌。

l  此外，特異性皮炎組和銀屑病患者的非皮損皮膚樣本微生物組成與健康對(duì)照組的正常皮膚樣本細(xì)菌組成非常相似。

圖1 銀屑病和特異性皮炎患者的皮損樣本和健康組正常皮膚樣本的門水平相對(duì)豐度

案例4  正常人和銀屑病患者皮膚真菌菌群的比較

 

中文題目：銀屑病患者皮膚真菌微生物分子鑒定

英文題目： Molecular characterization of the skin fungal microbiome in patients with psoriasis

發(fā)表雜志：J Dermatol

發(fā)表時(shí)間：2015    

研究對(duì)象：12例銀屑病患者和12名健康對(duì)照者，使用鑷子采集患者皮損樣本，使用透明敷料采集正常人皮膚樣本；

技術(shù)方法：26S rDNA擴(kuò)增子測(cè)序，D1/D2區(qū)；

研究平臺(tái)：Roche 454-FLX平臺(tái)；

研究結(jié)果：

l  馬拉色菌是兩組最豐富的序列（銀屑病46.9±14%，健康對(duì)照組76±14.6%）。

l  真菌微生物多樣性在銀屑病患者中顯著增高。

l  PCA分析顯示銀屑病患者和健康對(duì)照者的真菌微生物組成有顯著差異

圖1.  真菌在各分類群中的分布。

案例5  銀屑病患者水浴療法前后皮膚微生物變化

 

中文題目：銀屑病患者在理膚泉熱保健中心使用水浴療法前后皮膚微生物變化

英文題目：Skin Microbiome in Patients With Psoriasis Before and After Balneotherapy at the Thermal Care Center of La Roche-Posay

發(fā)表雜志：J Drugs Dermatol

發(fā)表時(shí)間：2015    

研究對(duì)象：54例診斷為中度至重度的尋常型銀屑病患者，采集富硒水浴療法治療前和治療3周后的患者樣本，從受影響端和近端未受影響的皮膚采集拭子樣本；

技術(shù)方法：16S rDNA擴(kuò)增子測(cè)序；

研究結(jié)果：

l  在治療前，銀屑病患者受影響的皮膚樣本和近端未受影響的皮膚樣本具有相似的微生物多樣性指數(shù)。

l  富硒水浴療法治療3周后，PASI值下降，意味著此水浴療法降低了疾病的嚴(yán)重程度。

l  在治療第三周結(jié)束時(shí)，銀屑病患者從受影響端皮膚樣本和近端未受影響皮膚樣本菌群結(jié)構(gòu)類似。

l  富硒水浴療法在受影響和不受影響皮膚樣本中增加了棒狀桿菌和黃單胞桿菌豐度，這個(gè)菌在溫泉和健康皮膚也被發(fā)現(xiàn)。

案例6  銀屑病關(guān)節(jié)炎患者腸道菌群結(jié)構(gòu)類似于炎性腸炎疾病患者

 

中文題目：銀屑病關(guān)節(jié)炎患者腸道菌群結(jié)構(gòu)與炎性腸炎疾病患者類似

英文題目：Decreased Bacterial Diversity Characterizes the Altered Gut Microbiota in Patients With Psoriatic Arthritis, Resembling Dysbiosis in Inflammatory Bowel Disease

發(fā)表雜志：Arthritis Rheumatol

發(fā)表時(shí)間：2015    

研究對(duì)象：17個(gè)銀屑病關(guān)節(jié)炎患者(PsA)，15個(gè)銀屑病患者(PS)，17個(gè)健康人(HLT)的糞便樣品；

技術(shù)方法：16S rDNA擴(kuò)增子測(cè)序，V1-V2區(qū)；

研究結(jié)果：

l  與健康組相比，銀屑病關(guān)節(jié)炎患者和銀屑病患者的腸道菌群結(jié)構(gòu)差異較??； 

l  與健康組相比，銀屑病關(guān)節(jié)炎患者及銀屑病患者的腸道菌群豐度相對(duì)較低，例如銀屑病關(guān)節(jié)炎患者和銀屑病患者的糞球菌屬比例都減少。在銀屑病關(guān)節(jié)炎患者中疣微菌屬、假丁酸弧菌屬、瘤胃球菌屬等菌屬豐度顯著降低，這說明銀屑病關(guān)節(jié)炎患者有益菌的豐度較低；

l  銀屑病關(guān)節(jié)炎患者腸道菌群結(jié)構(gòu)與炎性腸炎患者類似，與銀屑病患者和健康人菌群結(jié)構(gòu)不同。銀屑病關(guān)節(jié)炎患者腸道菌群結(jié)構(gòu)與特定的炎癥蛋白變化密切相關(guān)，例如在銀屑病關(guān)節(jié)炎患者中血清分泌IgA水平上升和RANKL水平下降；

l  脂肪酸分析顯示銀屑病關(guān)節(jié)炎患者和銀屑病患者含有較低水平己酸和庚酸；

圖1.  銀屑病關(guān)節(jié)炎患者，銀屑病患者和健康人菌群結(jié)構(gòu)差異。

關(guān)于天昊：

      天昊生物采用Miseq PE250測(cè)序策略對(duì)細(xì)菌16S rDNA區(qū)/真菌ITS區(qū)/真菌18S rDNA區(qū)的雙V區(qū)或多種單V區(qū)進(jìn)行測(cè)序，使用低循環(huán)數(shù)擴(kuò)增，保證每個(gè)樣品擴(kuò)增的循環(huán)數(shù)統(tǒng)一；采用特殊方法可有效避免系統(tǒng)內(nèi)誤差；數(shù)據(jù)質(zhì)量高，有效序列Q30達(dá)到80%以上；加上最新升級(jí)的分析內(nèi)容和解釋詳盡的結(jié)題報(bào)告，帶您享受極致的微生物擴(kuò)增子測(cè)序體驗(yàn)。