“工匠精神”不能停--2016天昊生物醫(yī)學(xué)基因組測(cè)序文章集錦

發(fā)稿時(shí)間：2017-01-13來(lái)源：天昊生物

感言

每個(gè)行業(yè)都需要“匠心”，這種精神代表了對(duì)自己所從事事業(yè)的全身心投入，對(duì)自己的產(chǎn)品/服務(wù)精雕細(xì)琢，精益求精、追求更完美的精神理念。天昊從2008年成立以來(lái)，追求的就是這種簡(jiǎn)單卻執(zhí)著的精神，力求為中國(guó)的科研工作者提供最專業(yè)的科研服務(wù)

回顧與期待

回顧2016，這種“匠心”協(xié)助我們的客戶發(fā)表了127篇文章，累計(jì)影響因子400+。對(duì)于醫(yī)學(xué)基因組測(cè)序方向，更是高分文章云集，累計(jì)影響因子90+，涉及到了全外顯子測(cè)序和富有天昊特色的多種目的區(qū)域測(cè)序技術(shù)平臺(tái)。“匠心”除了堅(jiān)持，更依賴于創(chuàng)新與特色。獨(dú)具天昊特色的多種通量目的區(qū)域測(cè)序平臺(tái)，受到了很多科研工作者的認(rèn)可，目前已經(jīng)成功完成了近90個(gè)大樣品量目的區(qū)域富集測(cè)序項(xiàng)目，樣本總量超過(guò)43000例，預(yù)示著2017年一大波好文章來(lái)襲！敬請(qǐng)期待~

接下來(lái)，就讓我們一起回顧一些醫(yī)學(xué)基因組方向的重點(diǎn)文章，期待2017年更多的收獲！

全外顯子測(cè)序文章

o    膽汁淤積性肝病是兒童期發(fā)展至肝硬化失代償，并需要肝移植的主要原因。遺傳性膽汁淤積癥致病基因數(shù)量眾多，目前仍有很多患者不能明確診斷，提示可能存在其它尚未發(fā)現(xiàn)的新致病基因。

o     本研究中，研究者首先應(yīng)用篩查63種已知遺傳性膽汁淤積癥致病基因靶向測(cè)序panel，精選了24例臨床表現(xiàn)為不明原因低GGT膽汁淤積的核心家系，進(jìn)行全外顯子組測(cè)序：測(cè)序結(jié)果中，有5個(gè)病例存在MYO5B基因的純合、復(fù)合雜合突變。進(jìn)一步的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析、肝組織免疫組化以及血漿膽汁酸譜分析表明，MYO5B突變與低GGT（血清γ谷氨酰胺）膽汁淤積癥存在明顯的相關(guān)性，肝組織病理表現(xiàn)與BSEP缺陷病例（一種常見(jiàn)的導(dǎo)致低GGT膽汁淤積癥的遺傳?。O為類似。隨后研究者在另一批7例不明原因低GGT膽汁淤積散發(fā)病例中找到2例攜帶MYO5B雙突變的病例；并通過(guò)后續(xù)進(jìn)行的二代測(cè)序，又確認(rèn)3例MYO5B純合/復(fù)合雜合突變、臨床表現(xiàn)為不明原因低GGT膽汁淤積病例。至此，研究者證明MYO5B基因突變是導(dǎo)致低GGT膽汁淤積癥的重要遺傳病因，可解釋大約20%的不明原因低GGT膽汁淤積癥。

o      該研究成果揭示了第一個(gè)由中國(guó)研究人員發(fā)現(xiàn)的膽汁淤積癥致病基因，并初步闡明了MYO5B缺陷導(dǎo)致膽汁淤積的臨床特點(diǎn)、在不明原因低GGT膽汁淤積癥中的比例、以及突變嚴(yán)重程度與不同表型的關(guān)系，為膽汁淤積癥的精確診斷向前推進(jìn)了一步。

目的區(qū)域測(cè)序文章

o    家族性高膽固醇血癥(FH)是一種罕見(jiàn)的常染色體顯性遺傳性疾病，其臨床特點(diǎn)是低密度脂蛋白（LDL）膽固醇數(shù)值異常超高，早發(fā)心血管疾病。其主要致病基因有低密度脂蛋白受體（LDLR）、載脂蛋白B100（ApoB）、枯草溶菌素9（PCSK9）

o    本研究共有8050例進(jìn)行血管造影的中國(guó)患者入組，F(xiàn)H診斷標(biāo)準(zhǔn)為荷蘭DLCNC診斷標(biāo)準(zhǔn)?；谕怙@子靶向測(cè)序檢測(cè)了245例可能/明確FH患者。

o    結(jié)果表明在所有接受造影檢測(cè)的患者中，約有3.5%為可能或明確家族性高膽固醇血癥患者（1%為明確，2.5%為可能），但無(wú)一人LDL-C達(dá)標(biāo)。約46.9%的可能/明確FH患者檢測(cè)到致病基因的變異。

斷裂富集測(cè)序文章

o    背景：核糖體RNA的轉(zhuǎn)錄是核糖體形成的限速步驟，而核糖體RNA基因所在的位置被認(rèn)為是人類基因組最脆弱的地方。研究發(fā)現(xiàn)核糖體RNA基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控與DNA雙鏈斷裂的熱點(diǎn)位置存在緊密關(guān)聯(lián)。葉酸(folate)是人體許多一碳反應(yīng)所必需的一類微量營(yíng)養(yǎng)素,含多種還原形式，是一組與 DNA 合成、甲基基團(tuán)轉(zhuǎn)移相關(guān)的重要中間介質(zhì)，對(duì)細(xì)胞的分裂和生長(zhǎng)以及表觀遺傳基因表達(dá)調(diào)控有著重要意義。

o    研究?jī)?nèi)容：本研究利用葉酸拮抗劑（一種神經(jīng)管畸形風(fēng)險(xiǎn)因素），探究了小鼠胚胎干細(xì)胞（mESCs）在葉酸缺乏狀態(tài)下的DNA雙鏈斷裂圖譜

o    主要結(jié)果：利用天昊生物的斷裂富集二代測(cè)序，本研究觀察到了葉酸缺乏引起的DNA雙鏈斷裂富集在rRNA基因處。此外，葉酸拮抗劑的處理可募集上游結(jié)合因子至rRNA基因，促進(jìn)其轉(zhuǎn)錄。

o    結(jié)論：本研究提示葉酸在維持基因組穩(wěn)定性中的重要性，同時(shí)展示了在發(fā)育早期葉酸水平如何通過(guò)表觀調(diào)控引發(fā)DNA斷裂，進(jìn)而調(diào)控rRNA基因的轉(zhuǎn)錄。該研究為神經(jīng)管發(fā)育畸形提示了新的研究視角。

圖：DNA雙鏈斷裂富集測(cè)序工作流程

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