天昊生物測序服務(wù)再創(chuàng)佳績：助力客戶登陸Nature子刊

發(fā)稿時間：2015-11-30來源：

天昊生物測序服務(wù)再創(chuàng)佳績：助力客戶登陸Nature子刊
    近日，天昊生物Illumina Hiseq2000和Miseq測序服務(wù)技術(shù)平臺，助力上海交通大學(xué)附屬第六人民醫(yī)院血液內(nèi)科李曉教授課題組，在骨髓增生異常綜合征(MyelodysplasticSyndrome，MDS)疾病進展相關(guān)的驅(qū)動因子研究中取得重要進展。研究團隊采用全外顯子及目的區(qū)域測序技術(shù)鑒別出了ROBO1和ROBO2突變，揭示了ROBO1和ROBO2基因在MDS疾病中的腫瘤生物學(xué)定義，證實了ROBO1突變可作為疾病進展的監(jiān)測指標(biāo)。相關(guān)研究成果近日發(fā)表在著名學(xué)術(shù)期刊Nature Communications《自然通訊》（IF=11.47），文章題目為“Whole-exome and targeted sequencing identify ROBO1 and ROBO2 mutations as progression-related drivers in myelodysplasticsyndromes”。
 
研究背景
    骨髓增生異常綜合征(MDS)是一類造血系統(tǒng)腫瘤性疾病，起源于惡性造血干/祖細(xì)胞、具有明顯的異質(zhì)性。其特點是髓系細(xì)胞分化及發(fā)育異常，表現(xiàn)為無效造血、難治性血細(xì)胞減少、造血功能衰竭，高達30%的MDS患者會向急性髓系白血?。ˋML）轉(zhuǎn)化。MDS疾病進展是影響患者生存時間的重大威脅，如何精準(zhǔn)的評估MDS患者的疾病進展是一個研究難題，目前正迫切需要確定促進MDS疾病進展的特異分子事件（驅(qū)動事件）。近年來，NGS及NES測序技術(shù)已成功鑒別部分MDS進展相關(guān)突變，如ASXL1、RUNX1、TET2、IDH1、IDH2 和SETBP1突變，但這些與疾病進展相關(guān)的突變?nèi)杂写炞C。
 
研究方法     李曉教授課題組首先對3名配對疾病進展患者的系列骨髓樣本進行了全外顯子組和目的區(qū)域測序，試圖發(fā)現(xiàn)與疾病進展相關(guān)的體細(xì)胞突變。外顯子組測序共發(fā)現(xiàn)了26個候選突變基因，并且發(fā)現(xiàn)1例病人存在ROBO1體細(xì)胞突變，另 1例病人存在ROBO2體細(xì)胞突變。通過對26個篩查到的候選基因和前期發(fā)現(xiàn)的13個MDS候選基因進行目的區(qū)域捕獲測序，最終，在16名配對患者中，有6名（37.5%）患者存在ROBO1和ROBO2體細(xì)胞突變，即是新的疾病進展相關(guān)體細(xì)胞突變。通過對包含193名MDS患者進行進一步的深度測序，檢測出20名(10.4%)患者具有ROBO突變。此外，在疾病進展或攜帶ROBO突變的患者中頻繁觀察到有ROBO1和ROBO2存在CNV及雜合度丟失（LOH）。ROBO1突變的患者呈現(xiàn)明顯縮短的生存時間及增加的白血病轉(zhuǎn)化風(fēng)險。
在體外實驗中，研究人員證實ROBO1和ROBO2是一個抑癌基因，ROBO1或ROBO2突變導(dǎo)致的ROBO/SLIT2信號失活可能推動疾病進展。 結(jié)論
    以上研究結(jié)果證實了ROBO突變對MDS發(fā)病機制的貢獻，首次鑒定了ROBO1/2突變是MDS疾病進展的驅(qū)動突變，豐富了MDS的突變譜，為研究MDS的疾病進展機制及拓展相應(yīng)的靶向治療提供了新的策略。
 
特別感謝
    天昊生物特別感謝上海交通大學(xué)附屬第六人民醫(yī)院血液內(nèi)科李曉教授課題組對天昊生物技術(shù)服務(wù)的認(rèn)可，感謝李曉教授課題組在上海交大醫(yī)學(xué)院新聞網(wǎng)對天昊生物合作支持的認(rèn)可。上海天昊生物將一直作為專業(yè)、認(rèn)真、嚴(yán)謹(jǐn)?shù)臏y序服務(wù)提供商，助力廣大科研工作者！



上海交大醫(yī)學(xué)院新聞網(wǎng)李曉研究組新成果鏈接：http://news.shsmu.edu.cn/default.php?mod=article&do=detail&tid=1019284#rd&sukey=fc78a68049a14bb20b0240b5ad0b7cdb6f063ee6dad20d85677d9bf75043489715018e366f2cf5767a3bec2850fd0c30